云中山自然保护区位于南亚热带与中亚热带之间的过渡地带，属中山地貌，山脉系戴云山脉向东南延伸部分，区内地势自西北向东南倾斜，地势兀突，地形复杂，沟谷纵横，属中亚热带季风气候，温暖湿润，雨量充沛，年降水量1619.7mm，光、热、水资源丰富。云中山地理位置独特，自然条件优越。区内还有大坑峡谷、龙潭坂瀑布、格口温泉、格口阔叶林、建于宋朝的太化遗址等一些难得的自然景观和人文景观。


     区内有维管植物152科496属939种，陆生野生动物25目69科283种，有国家一级重点保护植物南方红豆杉（成片分布约300亩）、国家二级重点保护植物桫椤1000多亩，有国家一级重点保护动物云豹、黄腹角雉等5种，国家二级重点保护动物穿山甲等35种，省重点保护动物黄腹鼬等19种，云中山自然条件优越，森林茂密，动物资源丰富，地带性植被类型、生态系统特征典型，具有潜在保护价值、科研价值和开发利用价值。