祁连山自然保护区1987年建立，1988年批准为国家级保护区，总面积2653000公顷。

　　一、地理位置

　　保护区位于甘肃、青海两省交界处，东起乌鞘岭的松山，西到金山口，北临河西走廊，南靠柴达木盆地。

　　二、自然环境

　　祁连山由一系列平行排列的山岭和谷地组成，其中包括走廊南山、冷龙岭、大黄山及毛毛山。一般海拔3000～5000米，主峰海拔5547米。受高原寒冷气候的影响，海拔4200米以上的高山地带，终年积雪，形成的冰川达2859条，总面积1972.5平方公里。冰雪融化成为羊河、黑河、疏勒河三大水系、56条内陆河流的源头，储水量132亿立方米，年径流量为72.6亿立方米，灌溉着河西走廊18.5万公顷的农田，养育着400万人民，也是农业、生活用水的唯一来源。

　　三、植物资源

　　高等植物1044种，其中蕨类植物14种，裸子植物10种，被子植物1020种。祁连山北坡植物垂直分布情况如下：

　　1.海拔1500～1800米为荒漠或绿洲河谷林带，凡土层深厚有灌溉条件的地段均已开垦为绿洲、果园，其它地段为牧场；

　　2.1800～2200米为山地荒漠草原，2000～2700米为山地草原，两段为优良的牧场；

　　3.2500～3200米（东部）、2700～3300米（西部）为山地森林草原带，分布着青海云杉等寒温针叶林（图1）；

　　4.3200～3800米（东部）、3300～3900米（西部）为亚高山灌丛草甸带；

　　5.3800米以上至雪线为高山冰雪稀疏植被或垫状植被带，生长着稀疏的点地梅、蚤缀、地衣等。

　　区内国家级保护植物二级有裸果木、半日花，三级有星叶草、桃儿七、蒙古扁桃、沙冬青、延龄草等。经济植物有锦鸡儿、野苜蓿、紫花针茅、沙棘（图2）等20种。药用植物有问荆、木贼、麻黄、何首乌、柴胡、刺五加（图3）、益母草、羌活等90余种，芳香植物有薄荷、小茴香、黄芩等；农药植物有狼毒白头菊、黄花蒿等10多种。

　　四、动物资源

　　祁连山自然保护区的野生动物，兽类58种，鸟类140多种，两栖、爬行类13种。动物分布垂直差异明显。2500米以下以野牦牛、赤狐、兔狲等为主；2500～3800米动物丰富，有白唇鹿（图4）、麝、猞猁、玖尾榛鸡、雉鹑、血雉等；3800米以上生活着高山耐寒动物，有雪豹、盘羊、岩羊、白尾海雕、藏雪鸡等。

　　区内有国家级保护动物39种，一级有白唇鹿、藏野驴（图5）、野骆驼、野牦牛、雪豹、白肩雕、白尾海雕、玉带海雕、金雕、胡兀鹫等12种，二级有白肩鹿、麝、猞猁（图6）、蓝马鸡、藏雪鸡、藏原羚、盘羊、岩羊、石貂、血雉等。昆虫有200多种，其中祁连山高山绢蝶为世界珍稀种。